样品瓶密封盖是由塑料或金属盖加密封垫组成的，有可多次使用的螺旋盖和一次使用的压盖两种。现在自动进样器上多采用一次性使用的铝制压盖，使用压盖器压紧后可以保证密封性能。

密封垫的材料主要由三种，即硅橡胶、丁基橡胶和氟橡胶。丁基橡胶垫价格低，硅橡胶垫耐高温性能好，氟橡胶垫惰性好。为了防止密封垫对样品组分的吸附，现在多用内衬聚四氟乙烯或铝的密封垫。

选用密封垫时要看分析条件（温度）和样品具体情况而定。常规分析可用价格低的丁基橡胶垫，痕量分析则最好用内衬的硅橡胶垫。必要时，通过空白分析来确证密封垫中的挥发物不干扰分析。

密封垫在刺穿一次（取样）后，就可能会漏气，而且内衬垫扎穿之后就失去了保护作用，橡胶基体有可能吸附样品组分。所以，需要从一个样品瓶多次进样时，最好连续进行，不要把扎穿过密封垫的样品瓶放置一段时间后再用。